Coper es un pueblo de origen indigena, existe desde antes de la conquista. la tribu que habitaba este caserío estaba gobernada por un cacique, jefe tributario del poderoso señor los muzos.

El conquistador capitán Luis Lancheros libró en 1540 una batalla con los indios muzos, batalla que se verificó cerca al rio villamizar. Lancheros derrotó a los indios con ayuda de los perros que trajerón a los españoles a estas altiplanicies. El historiador colonial presbitero doctor Basilio Vicente de Oviedo escribió en 1763 un libro titulado " cualidades y riquezas del nuevo reino de granada".

El doctor Oviedo dice "copere - el curato del pueblo de copere, con su razonable iglesia con algún ormamento, esta hacia el este de muzo. tendrá 30 indios y 150 blancos .

Es tierra templada. Produce algodón los demas frutos que se ha dicho. Rentara este curato 600 pesos y lo colocamos en cuarto orden de nuestra escala. Creo que su temperamento es benigno y su administración algo trabajosa porque la tierra es trabajosa y de lodazales".
El arsobispo de Santa fe doctor don Agustín de Alvarado y Castillo dictó un decreto en 1776 sobre nuevas parroquias " en donde quiera que no las pidan los feligreses".

Los habitantes de copere solicitaron que el caserío fuera elevada a l categoría de parroquia. primitivamente este pueblo se llamaba con el nombre de Copere, después se le quito la "e" final y quedo coper.

Coper pertenece a la provincia de occidente del Departamento de Boyacá, dista de la capital del departamento 133 Kms., su cabecera está localizada a los 05º 28' 40" de latitud Norte y 74º 02' 55" de longitud Oeste. Sus altitudes oscilan entre las cotas de 600 y 2600 m.s.n.m. Las condiciones climáticas nos presentan una Temperatura media de 23°C y una Precipitación media anual de 3.152 mm; lo cual permite que en el mismo territorio confluyan tres pisos climáticos y por ende diversidad de productos.

El casco urbano se encuentra ubicado a 950 m.s.n.m.
Limita por el Norte con el Municipio de Maripí (Boyacá), por el Sur con los Municipios de Paime y San Cayetano (Cundinamarca), por el Occidente con los Municipio de Muzo (Boyacá) y Paime y por el Oriente con los Municipio de Buenavista (Boyacá) y Carmen de Carupa (Cundinamarca).

Coper tiene una extensión de 202 Kms2 y por su topografía presenta tres pisos térmicos así: Caliente, 171 Kms2, Templado 17 Kms2 y Frío 14 Kms2
Administrativamente está dividido en 10 veredas: Cantino, Resguardo, Guasimal, Santa Rosa, Turtur, Guayabal, Pedro Gómez, Cucunubá, Páramo y Ricaurte. Los límites veredales se demarcan en general por divisorias de aguas o ríos importantes, por lo cual existe coincidencia con las cuencas hidrográficas.

El casco urbano municipal se encuentra en la vereda resguardo la cual debe su nombre al resguardo indígena existente en la zona a finales del siglo XVI. Las veredas más cercanas al casco Urbano son Guasimal, Páramo, Santa Rosa, y Cantino, mientras que Turtur, Guayabal, Cucunubá, Pedro Gómez y Ricaurte son las más alejadas.

Coper pertenece a la Hoya del río Minero y tiene varios afluentes. En su jurisdicción se encuentran los siguientes ríos: Villamizar, Guazo o Cantino, Palenque y Turtur. Además es regado por las quebradas de: Santa rosa, Gasparón, Colorada, Palmichal, Arenal, La Loja y de los Monos, San Rafael, Negra, San Pedro, Chorrera, Cangrejera, Chorrerón, Ramal, Agua Azul, La Salina, el Salto, Sororí, Zapotal, Carbonera, Subicha, Chiripí y Agua Fría.
El río Villamizar sirve de límites con los municipios de San Cayetano, Paime y Muzo. El promedio de lluvias anual es de 1662 m.m.

Límites del municipio:

Coper limita por el Norte con el Municipio de Maripí (Boyacá), por el Sur con los Municipios de Paime y San Cayetano (Cundinamarca), por el Occidente con los Municipio de Muzo (Boyacá) y Paime y por el Oriente con los Municipio de Buenavista (Boyacá) y Carmen de Carupa (Cundinamarca).

Extensión total: 202 Km2

Extensión área urbana: 2 Km2

Extensión área rural: 200 Km2

Altitud (metros sobre el nivel del mar): 950

Temperatura media: 23 Centígrados

Distancia de referencia: 65 Km a

Chiquinquirá y 133 a la ciudad de Tunja.