Morelia se localiza al sur occidente de la ciudad de Florencia, capital del Departamento del Caquetá, a una distancia de 24 Km , en un punto intermedio entre Florencia y Belén de los Andaquíes sobre la carretera Troncal del Oriente.

El territorio municipal comprende una extensión de superficie de 46468 hectáreas (464.7 Km2), perteneciendo casi todo al sector rural y distribuyéndose en 4 grandes paisajes fisiográficos: paisaje de la Montaña , paisaje de Piedemonte, paisaje de Lomerío y el paisaje del Valle.

Morelia se fundó el 10 de septiembre de 1992 como corregimiento del Bodoquero, el cual hacía parte de la comisaría especial del Caquetá que para 1926 contaba con ocho corregimientos: San Vicente del Caguan, Yarí, Curiplaya, Belén de los Andaquíes, Guacamayas, Puerto Rico, Solano y Bodoquero (hoy municipio de Morelia.) A partir de 1950 el corregimiento de Morelia pasa a ser Inspección Rural del municipio de Belén de los Andaquíes según el Decreto 3 del 14 de abril de 1950, Morelia siendo Inspección Rural de Belén de los Andaquíes pasa a ser Inspección intendencial y según Decreto 026 del 4 de febrero de 1965 La Inspección de Morelia se erige como corregimiento de la Intendencia del Caquetá. Finalmente, según la Ordenanza 03 del 12 de Noviembre de 1985 y registrada el 01 de enero de 1986, se crean ocho (8) nuevos Municipios en el Departamento del Caquetá, entre ellos el de Morelia. El territorio de Morelia es el producto de los procesos de colonización sucedidos a mediados del siglo, aunque la fundación del caserío se haya hecho a comienzos de los años veinte, la consolidación de su territorio se presenta con la llegada masiva de colonos desplazados por la violencia del interior del país.

La actividad economíca de nuestro Municipio se deriva principalmente de la ganadería, la agricultura y el turismo; este ultimo florece gracias a la existencias de los hermosos y caudalosos ríos Bodoquero y Pescado complementados por las quebradas San Gil, La Raya y Agua Caliente.